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Présentation phylogénétique du microbiote, taxonomie des bactéries intestinales
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Estomac : physiologie, métabolisme, interactions avec le microbiote, nutrition et supplémentation des pathologies gastro-duodénales : troubles fonctionnels, infection à H. pylori, gastrite, ulcères gastrique et duodénaux, reflux gastro-oesophagien
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Acides biliaires : physiologie, métabolisme, rôles traditionnels et pléiotropes (réponse immuno-inflammatoire, homéostasie des glucides et des lipides, interactions avec le microbiote, etc.), nutrition et supplémentation des pathologies et troubles fonctionnels liés au dérèglement des acides biliaires
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Barrières et immunité intestinales : jonctions serrées, mucus intestinal, immunoglobulines A sécrétoires, tissu lymphoïde associé à l’intestin (GALT) (récepteurs membranaires de perception des signaux bactériens, Treg, cellules dendritiques)
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Métabolites du microbiote intestinal et santé humaine : acides gras à chaines courtes (butyrate, acétate, propionate) et ramifiés (valérate, isobutyrate, isovalérate), gaz, composés phénoliques et indoliques, amines, métabolisme du tryptophane (voie de la sérotonine, voie de la kynurénine, voie de l’indole), TMAO
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Dysbiose intestinale : types de dysbiose, SIBO, parasitose, candidose
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Nutrition et supplémentation du microbiote :
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Influence des régimes alimentaires : alimentations occidentale « western diet », méditerranéenne, cétogénique, sans gluten, sans FODMAPs
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Influence des composés alimentaires : glucides digestibles et non digestibles, fibres solubles, amidons résistants, glycanes, lipides, protéines, acides aminés, sel, édulcorants, émulsifiants alimentaires, micronutriments, polyphénols, probiotiques
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